Hurtigguider for oversettelse av søkestrategi fra OVID for andre grensesnitt

Fra OVID til Cochrane

adj=NEXT
adj1=NEAR/1
adj2=NEAR/2
kid?=kid OR kid?
$=*
).tw.=):ti,ab,kw

Fra OVID til Cinahl

adj=W0
adj1=N0
adj2=N1
?=#
$=*
TI ( (søkeord) ) OR AB ( (søkeord) )
(MH "Alcoholism")

Fra OVID til SA

adj=P/0
adj1=N/0
adj2=N/1
?=NEI (kid or kid?)
$=*
AB,TI(søkeord or søkeord)
SU.EXACT("Discussion Groups")

 

Fra OVID til CRD

adj=NEAR0

adj2=NEI fordi de tar hensyn til rekkefølgen av ordene. Man må sette de begge veier med NEAR1

kid?=kid OR kid?

$=*

 

Fra OVID til ISI

adj= NEI

adj1=NEAR/0

adj2=NEAR/1

?=$

$=*

Pubmed..."young people"[Title/Abstract] or young person*[Title/Abstract] or student[Title/Abstract] or students[Title/Abstract]

Begrense et søk i PubMed til artikler som er Epub ahead of print

Dersom man kjører et søk i "Ovid MEDLINE(R) In-Process & Other Non-Indexed Citations, Ovid MEDLINE(R) Daily and Ovid MEDLINE(R) 1946 to Present" istedet for vanlig Ovid Medline, vil tilleggsverdien av å søke i PubMed begrense seg til artikler som er «Epub ahead of print».

For kun finne disse artiklene i PubMed kombinerer man søket med AND pubstatusaheadofprint.

For eksempel: diabetes[tiab] AND pubstatusaheadofprint

Info om flere «Subsets» i PubMed:

Status Tag	How to Search	Citation Status
PubMed - as supplied by publisher	publisher[sb] NOT pubstatusnihms NOT pubstatuspmcsd NOT pmcbook	Citations recently added to PubMed via electronic submission from a publisher, and are soon to proceed to the next stage, PubMed - in process (see below). This tag is also on citations received before late 2003 if they are from journals not indexed for MEDLINE, or from a journal that was accepted for MEDLINE after the citations' publication date. These citations bibliographic data have not been reviewed.
PubMed - in process	in process[sb]	Citations bibliographic data will be reviewed and indexed, i.e., MeSH terms will be assigned (if the subject of the article is within the scope of MEDLINE).
PubMed - indexed for MEDLINE	medline[sb]	Citations that have been indexed with MeSH terms, Publication Types, Substance Names, etc., and bibliographic data have been reviewed.
PubMed	pubstatusnihms AND publisher[sb]	Author manuscripts submitted to PMC that fall under the NIH Public Access Policy.
PubMed	pubstatuspmcsd AND publisher[sb]	Records for selective deposit articles in PMC. These are articles published in non-MEDLINE journals where the publisher has chosen to deposit in PMC only those articles that fall under the NIH Public Access Policy..
PubMed	pmcbook	Book and book chapter citations available on the NCBI Bookshelf.
PubMed	pubmednotmedline[sb]	Citations that have been reviewed for accurate bibliographic data but will not receive MEDLINE indexing, because they are for articles in non-MEDLINE journals, or they are for articles in MEDLINE journals but the articles are out of scope or they are from issues published prior to the date the journal was selected for indexing, or citations to articles from journals that deposit their full text articles in PMC but have not yet been recommended for indexing in MEDLINE.
PubMed - OLDMEDLINE	oldmedline[sb]	This tag identifies citations in the OLDMEDLINE subset.

Tekstord i OVID (.tw.)

Der er forskjellige felter det søkes i ved .tw.-søk i OVID: 

 

§MEDLINE: ti, ab

§EMBASE: ti, ab, tn

§PsycINFO: ti, ab, id, tc

§AMED: ti, ab, hw

EMBASE: TN=Drug Trade Name (the trade name for a drug or device discussed in an article)
PsycINFO: ID=Key Concepts (keywords added by indexers); TC=Table of Contents (exists in book records)

Avgrense til ett eller flere Cochrane-gruppe-register eller til håndsøkte referanser i CENTRAL

CENTRAL kan avgrenses til referanser fra ett eller flere Cochrane-gruppe-register eller til håndsøkte referanser ved å søke på de ulike registerkodene eller håndsøkekoden.

Kodeoversikt finner du her: http://www.thecochranelibrary.com/view/0/CENTRALHelp.html.


OBS: Felles kode for alle håndsøkte referanser er: HS-HANDSRCH (ikke HS-HANDSEARCH  - det skulle tatt seg ut!)

mvh Marit

Google tilpasset søk

Google tilpasset søk kan brukes til å samle selvvalgte nettsider for å gjøre enkle, federerte søk. Legg inn lenker (url) til nettsidene du vil søke i, eventuelle avgrensninger (obs! - søkefunksjoner kan variere) og kjør et testsøk! Søkeordet ditt sendes til alle url'ene på listen og returnerer trefflisten.
Canadian HTA sites er CADTH's variant
greylitnet.ih er min testside for å se om det kan være nyttig f.eks. for håndsøk etter grå litteratur. Prøv, og kommenter!

Vising av søkehistorikk i OVID

Skriver man ..ps i søkefeltet i OVID, vil man få dette skjermbildet. Vakkert!

For at det nå skal se pent ut i Word:
-Slett kolonnen med "Advanced"
-Høyreklikk i tabellen --> Egenskaper for tabell --> Kantlinjer og skyggelegging: Merk av for "Hele" --> OK --> Alternativer: Fjern krysset på "Tillat avstad mellom celler"--> OK --> OK

-Marita-

Oppskrift for federerte søk i OVID - ved hjelp av “use”

Oppskrift mottatt fra Dave Kaunelis i CADTH, Canada:

You can limit a single search line within a search to a specific database or databases by using the Ovid field codes assigned to each database. Ovid database codes can be difficult to find so I have listed the codes for all databases that CADTH subscribes to (see end of this message). For other database, you may need to contact Ovid for the field code.

Removing duplicates:

First, prepare and save your individual database searches separately. Then open all the databases you have searched. This is what Ovid calls a multifile search. Run one of the searches, EMBASE 1980-present, for example.

EMBASE search
Line 1. dogs.ti
Line 2 cats.ti
Line 3. pigs.ti
Line 4. rabbits.ab
Line 5. or/1-4

Line 6. 5 use emez

Line 6 will limit the results of this part of the search to the Embase database only [emez is the 1980-present Embase field code]

Then run another of your individual database searches (Medline 1950-present, for example) with all databases still open.

MEDLINE search
Line 7. dogs.ti,ab
Line 8. cats.hw
Line 9. pigs.mp
Line 10. rabbits.ti,ab,hw
Line 11. or/7-10

Line 12. 11 use mesz

Line 12 will limit the results of this part of the search to the Medline 1950-present database.

Then run any other searches from other databases.

Then OR your results together (Line 6 or Line 12 or …)

Then remove duplicates.


You can also use this feature in other ways. See the example below for limiting specific lines within a multifile search to a specific database by using Ovid database codes.

exp tramadol/ [retrieves items from all databases open]
exp *tramadol/ use emef [retrieves items only from EMBASE]
tramadol.ti,ab,hw use prem,mesz,b10o89 [retrieves items from PreMedline, Medline, Biosis]


Ovid Database Codes
for 2010
(field codes in parentheses)

Biosis
BIOSIS Previews 1985 to 1989 (biol85)
BIOSIS Previews 1989 to present (b10o89) [note: this code changes yearly – the code for 2011 will likely be b11o89]

EBM Reviews
EBM Reviews - ACP Journal Club 1991 to September 2008 (acp)
EBM Reviews - Cochrane Central Register of Controlled Trials current update (cctr)
EBM Reviews - Cochrane Database of Systematic Reviews current update (coch)
EBM Reviews - Database of Abstracts of Reviews of Effects current update (dare)
EBM Reviews - Cochrane Methodology Register current update (clcmr)
EBM Reviews - Health Technology Assessment current update (clhta)
EBM Reviews - NHS Economic Evaluation Database current update (cleed)
The short code for ALL EBM Reviews is ebmz
The short code for EBM Reviews Full Text is ebmy

Embase
EMBASE 1996 to present (emef)
EMBASE 1988 to present (emed)
EMBASE 1980 to present (emez)
EMBASE 1988 to 1995 (emem)
EMBASE 1980 to 1987 (emeb)

ERIC
ERIC 1965 to present (eric)

Medline
Ovid MEDLINE(R) In-Process & Other Non-Indexed Citations and Ovid MEDLINE(R) 1950 to Present (prmz)
Ovid MEDLINE(R) 1950 to present (mesz)
Ovid MEDLINE(R) 1996 to present (medf)
Ovid MEDLINE(R) 1950 to 1995 (medb)
Ovid MEDLINE(R) In-Process & Other Non-Indexed Citations current (prem)
Ovid MEDLINE(R) Daily Update current (mesx)
Ovid MEDLINE(R) 2003 to present (medl)
Ovid MEDLINE(R) 1996 to 2002 (med3)
Ovid MEDLINE(R) 1980 to 1995 (med2)
Ovid MEDLINE(R) 1950 to 1979 (med1)
Ovid OLDMEDLINE(R) 1950 to 1965 (medo)

PsycINFO
PsycINFO 2000 to present (psya)
PsycINFO 1985 to present (psyf)
PsycINFO 1967 to present (psyb)
PsycINFO 1806 to present (psyh)
PsycINFO 1806 to 1966 (psy1)

SØK i CINAHL (Ebsco)

Syns denne fortjente et eget innlegg.

- Fra 1981 –

- Sykepleie + Kvalitativ forskning

- CINAHL Headings

- CINAHL Subheadings

- Wildcard – truncation
? - erstatter en bokstav, midt i eller på slutten av et ord
# - erstatter eller erstatter ikke en bokstav, midt i eller på slutten av et ord
* - legger til ingen, en eller flere bokstaver på slutten av et ord

- Operatorer
AND – OR – NOT
Nn - NEAR - beholder eller snur rekkefølgen på ordene
Wn - WITHIN - beholder rekkefølgen på ordene

- Stoppord overses. Se Ebscos stoppordliste

- ”Exact phrase”, men kun fraser uten stoppord/operatorer, søkes med doble anførselstegn

- Søk på bindestreksord gir treff på ordet med og uten bindestrek

- Søk på entallsform av et ord gir treff på entallsform, flertallsform og genitivform

- Søk på flertallsform av et ord gir kun flertallsformen (+)

- Eksempel på PT - publikasjonstype
Systematic review
Clinical trial
Search strategy

- EM - Entry Date
- Avgrense med EM
EM 2000 gir referansene som kom inn i 2000
EM 200012 gir referansene som kom inn i desember 2000
EM 200012- gir referansene som kom inn fra og med desember 2000 og til søkedato
EM -200012 gir referansene som kom inn før og til og med desember 2000

- Clinical Queries

- Andre filter
RCT

 

 

 

 

 

 

 

CRD (SR)filter brukt for DARE
S1 (MH "Meta Analysis") S2 TI metaanaly* or AB metaanaly* S3 TI meta-analy* or AB meta-analy* S4 AB cochrane or TI cochrane S5 PT nursing interventions S6 PT systematic review S7 TI review* or TI overview* S8 MH "Literature Review+") S9 MH "Literature Searching+") or (MH "Computerized Literature Searching+") S10 TX synthes* N3 literature* or TX synthes* N3 research or TX synthes* N3 studies or TX synthes* N3 data S11 TX medline or medlars or embase or scisearch or psycinfo or psychinfo or psychlit or psyclit S12 TX pooled analy* or TX data N2 pool* S13 TX hand N2 search* or TX manual N2 search* or TX database* N2 search* or TX computer* N2 search*S14 (MH "Reference Databases+") or (MH "Reference Databases, Health+") S15 TX electronic* N2 database* or TX electronic* N2 data base* or TX bibliographic* N2 database* or TX bibliographic* N2 data base* S16 PT review S17 AB systematic* or AB methodologic* or AB quantitative* or AB research* or AB literature* or AB studies or AB trial* or AB effective*S18 S17 and S16 S19 AB systematic* N10 review* or AB methodologic* N10 review* or AB quantitative* N10 review* or AB research* N10 review* or AB literature* N10 review* or AB studies N10 review* or AB trial* N10 review* or AB effective* N10 review*S20 AB systematic* N10 overview* or AB methodologic* N10 overview* or AB quantitative* N10 overview* or AB research* N10 overview* or AB literature* N10 overview* or AB studies N10 overview* or AB trial* N10 overview* or AB effective* N10 overview* S21 S20 or S19 or S18 or S15 or S14 or S13 or S12 or S11 or S10 or S9 or S8 or S7 or S6 or S5 or S4 or S3 or S2 or S1 S22 PT book review S23 S21 not S22 S24 SO cochrane database of systematic reviewsS25 s23 not s24

CRD (Cost)filter brukt for NHSEED
S1 MH "Economics+"
S2 MH "Financial Management+"
S3 MH "Financial Support+"
S4 MH "Financing, Organized+"
S5 MH "Business+"
S6 S2 OR S3 or S4 OR S5
S7 S1 NOT S6
S8 MH "Health Resource Allocation"
S9 MH "Health Resource Utilization"
S10 S8 OR S9
S11 S7 OR S10
S12 TI (cost or costs or economic* or pharmacoeconomic* or price* or pricing*) OR AB (cost or costs or economic* or pharmacoeconomic* or price* or pricing*)
S13 S11 OR S12
S14 PT editorial
S15 PT letter
S16 PT commentary
S17 S14 or S15 or S16
S18 S13 NOT S17
S19 MH "Animal Studies"

- Limits
Exclude MEDLINE referanser
Limit til Inpatients
Limit til Outpatients

- Bruk Clear knappen flittig

"Toppe opp"

Toppe opp CENTRAL
CENTRAL laster ned treff fra følgende strategi 4 ganger i året:
#1. randomized controlled trial[PT]
#2. controlled clinical trial[PT]
#3. #1 or #2
#4. limit #3 to human

For å ytterligere toppe opp CENTRAL:
MEDLINE fra og med 2005 (ed,ep,yr) – til i dag
EMBASE fra og med 2007 (em,yr) – til i dag

Se omtale av CENTRAL:
http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/mrwhome/106568753/CENTRALHelpFile.html


Toppe opp DARE (CRD eller Cochrane Library)
Søk basene som inngår i CRD sitt søk minst ett åt tilbake i tid. (Mail fra Julie i 2008)

Toppe opp CMR
MEDLINE fra og med 2000
EMBASE fra og med 2004

Se omtale av CMR:
http://www.mrw.interscience.wiley.com/cochrane/clabout/articles/METHOD/frame.html

PubMed vs MEDLINE

Avgrense søk i PubMed til de referansene som ikke ligger i MEDLINE

1. Kjør et søk
2. Kjør det samme søket med avgrensning til MEDLINE i "limit boxen" Subsets
3. Opphev avgrensningen
4. Søk: søk1 NOT søk 2 – overskuddet er det som ikke er indeksert i MEDLINE (Ovid)

#3 Search #1 NOT #2 (255)
#2 Search developing countries[ti] Limits: MEDLINE (5267)
#1 Search developing countries[ti] (5522)

Sensitivity, specificity og precision

Hei,

Her er definisjonene til sensitivity, specificity og precision som jeg nevnte på forrige bibliotekarmøte:

Sensitivity
Relevant records retrieved / total relevant records

Precision
Relevant records retrieved / total records retrieved

Specificity
Irrelevant records NOT retrieved / total irrelevant records

Mvh
Sari

E-post liste og ISSG's ressursside

Hei, og takk for nyttig møte fredag!

To lenker jeg synes er nyttige

1. E-post listen jeg nevnte

2. InterTASC Information Specialists' Sub-Group's (ISSG) Ressursside om bl.a. søkefiltre

Hilsen Ingrid

Om sensitivity, specificity, precision og recall

Noen foreløpige tanker…

Forkunnskap om sensitivity og specificity og filtre
Clinical Queries f.eks. opererer med disse to begrepene, og vil ha oss til å velge mellom dem når vi velger filter
-Et sensitivt filter favner vidt og har fokus på å fange opp "alle" artikler med det aktuelle studiedesignet (som betyr at det drar med seg en del urelevante ting i tillegg)
-Et spesifikt filter er smalt og har fokus på å luke ut artikler som ikke har det aktuelle studiedesignet (som betyr at det sannsynligvis luker ut en del relevante ting i tillegg)
-(Optimized er den gylde middelvei mellom disse)

Drømmefilteret har både høy sensitivitet og spesifisitet.

I diskusjonen vår hadde vi følgende konklusjoner
-Sensitivity og Recall er det samme
-Specificity skal rapporteres opp mot en gullstandard. Dette er ikke tilfelle for Precision
-Specificity besvarer spørsmålet "Hvor stor andel av de relevante artikler fant vi ikke?"
-Precision utrykker hvor stor andel av artiklene vi fant var relevante?
Precision, recall og sensitivity tar for seg det vi har funnet, mens specificity tar for seg det vi ikke har funnet.

Jeg merker jeg har litt problemer med å få det jeg allerede vet om filtre til å stemme overens med konklusjonene vi kom til på møtet.

.ep. i Medline (Electronic date of publication.)

For å avgrense til et tidsspenn...
Per januar 2010 har MEDLINE Ovid følgende avgrensingsmuligheter på tid:

DP
The Date of Publication (DP) field consists of the date of publication for a citation, in the format YYYY MMM DD (1950 dec 3). The Month and day are not always present. This field is also displayed as part of the Source (SO) field.
EP
The Electronic Date of Publication (EP) is the date the record was sent to NLM for inclusion in MEDLINE (R). This index appears in the format YYYYMMDD.
ED
The Entry Date (ED) field contains the issue (year, month and day) in which the document was indexed as a MEDLINE (R) record. This index appears in the format YYYYMMDD.
UP
The Update Date (UP) field contains the date the record was added to MEDLINE since the yearly reload completion. The Update Date for existing records changes with each global reload to reflect the date Ovid starts processing the reload data. The UP field appears in the format YYYYMMDD.
YR
The Year of Publication (YR) field contains the year in which an article or monograph was published. Only the four digit year is contained in the index.



Følgende er muligens utdatert/feil!
For å avgrense til et tidsspenn da referanser ble publisert i Medline, bruk .ep., ikke .ed.

The Electronic Date of Publication (EP) is the date the record was sent to NLM for inclusion in MEDLINE (R). This index appears in the format YYYYMMDD.

The Entry Date (ED) field contains the issue (year, month and day) in which the document was indexed as a MEDLINE (R) record. This index appears in the format YYYYMMDD.

Referanser publisert mellom 01 september 2005 og 01 mai 2008:
1. 200509$.ep.
2. 200510$.ep.
3. 200511$.ep.
4. 200512$.ep.
5. 2006$.ep.
6. 2007$.ep.
7. 200801$.ep.
8. 200802$.ep.
9. 200803$.ep.
9. 200804$.ep.
10. or/1-9

Trunkering av systematic i review-filteret i Medline

Her kommer altså første sak i serien "godt å vite".

Som vi har snakket om på flere møter, trunkerer ikke det innebygde review-filteret i Ovid Medline hverken systematic eller review som tekstord når man bruker det spesifikke Clinical Queries-søket. Man får dermed ikke treff i referanser hvor det for eksempel er beskrevet at "we systematically reviewed". Ved nærmere testing viser det seg at de tilfellene man går glipp av i all hovedsak består av systematiske oversikter over kvalitative studier. Dette vil altså ikke være et problem for oss normalt, men allikevel viktig å huske på dersom man leter etter kvalitative SRer.

Ny blogg

Da har jeg opprettet en blogg til oss. Jeg er administrator med alle rettigheter, dere kommer til å bli invitert til å bli medforfattere.

Slik blir du medforfatter i bloggen
1) Opprett en gmail / google -konto (dersom du ikke allerede har dette). Dere kan f.eks. registrere dere her: https://www.blogger.com/signup.g

2) Send meg e-postadressen deres, og deretter sender jeg dere en e-post der det vil stå følgende:

Elanor har invitert deg til å bidra til bloggen sin, "Bibliotekarenes kunnskapsbank". Klikk på knappen under for å godta denne invitasjonen.

[Godta invitasjonen]
Viktig: Du må logge deg på med en Google-konto for å kunne godta invitasjonen og begynne å bidra til denne bloggen. Hvis du ikke har noen Google-konto, kan du opprette en her.
God blogging!
3) Klikk på lenken, og følg instruksene videre.


Om visningsnavn
Dette trenger ikke være fullt navn dersom dere ikke ønsker det. Jeg gjør oppmerksom på at mitt visningsnavn er "Elanor". Dette fordi jeg er tilknyttet flere blogger med min gmail-konto og jeg ikke ønsker bruke mitt egentlig navn på disse. For å unngå forvirring, skal jeg passe på å skrive under med "Marita" når jeg publiserer innlegg.

Om å publisere innlegg
Når du har blitt medforfatter i bloggen, og kan publisere innlegg i den. For å publisere på bloggen bruker du adressen blogger.com og logger deg inn. For å opprette et innlegg, bruker du lenken "Nytt innlegg".

Litt om etiketterDet er flere måter å finne frem i denne bloggen på:
-Lete deg frem kronologisk
-Søke i søkeboksen øverst på siden
-Etiketter

Etiketter er ord som beskriver innholdet i innlegget. Vi kan bruke så mange vi vil pr. innlegg. I dette innlegget har jeg brukt Blogging som etikett. Derfor står det nå Blogging (1) i etikettmenyen til høyre. Dersom jeg bruker denne etiketten i et innlegg til, vil det stå Blogging (2). Klikker jeg på denne lenken vil de to innleggene som handler om blogging komme opp.


-Marita-