Hei, og takk for nyttig møte fredag!
To lenker jeg synes er nyttige
1. E-post listen jeg nevnte
2. InterTASC Information Specialists' Sub-Group's (ISSG) Ressursside om bl.a. søkefiltre
Hilsen Ingrid
mandag 23. november 2009
onsdag 7. oktober 2009
Om sensitivity, specificity, precision og recall
Noen foreløpige tanker…
Forkunnskap om sensitivity og specificity og filtre
Clinical Queries f.eks. opererer med disse to begrepene, og vil ha oss til å velge mellom dem når vi velger filter
-Et sensitivt filter favner vidt og har fokus på å fange opp "alle" artikler med det aktuelle studiedesignet (som betyr at det drar med seg en del urelevante ting i tillegg)
-Et spesifikt filter er smalt og har fokus på å luke ut artikler som ikke har det aktuelle studiedesignet (som betyr at det sannsynligvis luker ut en del relevante ting i tillegg)
-(Optimized er den gylde middelvei mellom disse)
Drømmefilteret har både høy sensitivitet og spesifisitet.
I diskusjonen vår hadde vi følgende konklusjoner
-Sensitivity og Recall er det samme
-Specificity skal rapporteres opp mot en gullstandard. Dette er ikke tilfelle for Precision
-Specificity besvarer spørsmålet "Hvor stor andel av de relevante artikler fant vi ikke?"
-Precision utrykker hvor stor andel av artiklene vi fant var relevante?
Precision, recall og sensitivity tar for seg det vi har funnet, mens specificity tar for seg det vi ikke har funnet.
Jeg merker jeg har litt problemer med å få det jeg allerede vet om filtre til å stemme overens med konklusjonene vi kom til på møtet.
Forkunnskap om sensitivity og specificity og filtre
Clinical Queries f.eks. opererer med disse to begrepene, og vil ha oss til å velge mellom dem når vi velger filter
-Et sensitivt filter favner vidt og har fokus på å fange opp "alle" artikler med det aktuelle studiedesignet (som betyr at det drar med seg en del urelevante ting i tillegg)
-Et spesifikt filter er smalt og har fokus på å luke ut artikler som ikke har det aktuelle studiedesignet (som betyr at det sannsynligvis luker ut en del relevante ting i tillegg)
-(Optimized er den gylde middelvei mellom disse)
Drømmefilteret har både høy sensitivitet og spesifisitet.
I diskusjonen vår hadde vi følgende konklusjoner
-Sensitivity og Recall er det samme
-Specificity skal rapporteres opp mot en gullstandard. Dette er ikke tilfelle for Precision
-Specificity besvarer spørsmålet "Hvor stor andel av de relevante artikler fant vi ikke?"
-Precision utrykker hvor stor andel av artiklene vi fant var relevante?
Precision, recall og sensitivity tar for seg det vi har funnet, mens specificity tar for seg det vi ikke har funnet.
Jeg merker jeg har litt problemer med å få det jeg allerede vet om filtre til å stemme overens med konklusjonene vi kom til på møtet.
onsdag 10. desember 2008
.ep. i Medline (Electronic date of publication.)
For å avgrense til et tidsspenn...
Per januar 2010 har MEDLINE Ovid følgende avgrensingsmuligheter på tid:
DP
The Date of Publication (DP) field consists of the date of publication for a citation, in the format YYYY MMM DD (1950 dec 3). The Month and day are not always present. This field is also displayed as part of the Source (SO) field.
EP
The Electronic Date of Publication (EP) is the date the record was sent to NLM for inclusion in MEDLINE (R). This index appears in the format YYYYMMDD.
ED
The Entry Date (ED) field contains the issue (year, month and day) in which the document was indexed as a MEDLINE (R) record. This index appears in the format YYYYMMDD.
UP
The Update Date (UP) field contains the date the record was added to MEDLINE since the yearly reload completion. The Update Date for existing records changes with each global reload to reflect the date Ovid starts processing the reload data. The UP field appears in the format YYYYMMDD.
YR
The Year of Publication (YR) field contains the year in which an article or monograph was published. Only the four digit year is contained in the index.
Følgende er muligens utdatert/feil!
For å avgrense til et tidsspenn da referanser ble publisert i Medline, bruk .ep., ikke .ed.
The Electronic Date of Publication (EP) is the date the record was sent to NLM for inclusion in MEDLINE (R). This index appears in the format YYYYMMDD.
The Entry Date (ED) field contains the issue (year, month and day) in which the document was indexed as a MEDLINE (R) record. This index appears in the format YYYYMMDD.
Referanser publisert mellom 01 september 2005 og 01 mai 2008:
1. 200509$.ep.
2. 200510$.ep.
3. 200511$.ep.
4. 200512$.ep.
5. 2006$.ep.
6. 2007$.ep.
7. 200801$.ep.
8. 200802$.ep.
9. 200803$.ep.
9. 200804$.ep.
10. or/1-9
Per januar 2010 har MEDLINE Ovid følgende avgrensingsmuligheter på tid:
DP
The Date of Publication (DP) field consists of the date of publication for a citation, in the format YYYY MMM DD (1950 dec 3). The Month and day are not always present. This field is also displayed as part of the Source (SO) field.
EP
The Electronic Date of Publication (EP) is the date the record was sent to NLM for inclusion in MEDLINE (R). This index appears in the format YYYYMMDD.
ED
The Entry Date (ED) field contains the issue (year, month and day) in which the document was indexed as a MEDLINE (R) record. This index appears in the format YYYYMMDD.
UP
The Update Date (UP) field contains the date the record was added to MEDLINE since the yearly reload completion. The Update Date for existing records changes with each global reload to reflect the date Ovid starts processing the reload data. The UP field appears in the format YYYYMMDD.
YR
The Year of Publication (YR) field contains the year in which an article or monograph was published. Only the four digit year is contained in the index.
Følgende er muligens utdatert/feil!
For å avgrense til et tidsspenn da referanser ble publisert i Medline, bruk .ep., ikke .ed.
The Electronic Date of Publication (EP) is the date the record was sent to NLM for inclusion in MEDLINE (R). This index appears in the format YYYYMMDD.
The Entry Date (ED) field contains the issue (year, month and day) in which the document was indexed as a MEDLINE (R) record. This index appears in the format YYYYMMDD.
Referanser publisert mellom 01 september 2005 og 01 mai 2008:
1. 200509$.ep.
2. 200510$.ep.
3. 200511$.ep.
4. 200512$.ep.
5. 2006$.ep.
6. 2007$.ep.
7. 200801$.ep.
8. 200802$.ep.
9. 200803$.ep.
9. 200804$.ep.
10. or/1-9
mandag 3. mars 2008
Trunkering av systematic i review-filteret i Medline
Her kommer altså første sak i serien "godt å vite".
Som vi har snakket om på flere møter, trunkerer ikke det innebygde review-filteret i Ovid Medline hverken systematic eller review som tekstord når man bruker det spesifikke Clinical Queries-søket. Man får dermed ikke treff i referanser hvor det for eksempel er beskrevet at "we systematically reviewed". Ved nærmere testing viser det seg at de tilfellene man går glipp av i all hovedsak består av systematiske oversikter over kvalitative studier. Dette vil altså ikke være et problem for oss normalt, men allikevel viktig å huske på dersom man leter etter kvalitative SRer.
Som vi har snakket om på flere møter, trunkerer ikke det innebygde review-filteret i Ovid Medline hverken systematic eller review som tekstord når man bruker det spesifikke Clinical Queries-søket. Man får dermed ikke treff i referanser hvor det for eksempel er beskrevet at "we systematically reviewed". Ved nærmere testing viser det seg at de tilfellene man går glipp av i all hovedsak består av systematiske oversikter over kvalitative studier. Dette vil altså ikke være et problem for oss normalt, men allikevel viktig å huske på dersom man leter etter kvalitative SRer.
Ny blogg
Da har jeg opprettet en blogg til oss. Jeg er administrator med alle rettigheter, dere kommer til å bli invitert til å bli medforfattere.
Slik blir du medforfatter i bloggen
1) Opprett en gmail / google -konto (dersom du ikke allerede har dette). Dere kan f.eks. registrere dere her: https://www.blogger.com/signup.g
2) Send meg e-postadressen deres, og deretter sender jeg dere en e-post der det vil stå følgende:
Elanor har invitert deg til å bidra til bloggen sin, "Bibliotekarenes kunnskapsbank". Klikk på knappen under for å godta denne invitasjonen.
[Godta invitasjonen]
Viktig: Du må logge deg på med en Google-konto for å kunne godta invitasjonen og begynne å bidra til denne bloggen. Hvis du ikke har noen Google-konto, kan du opprette en her.
God blogging!
3) Klikk på lenken, og følg instruksene videre.
Om visningsnavn
Dette trenger ikke være fullt navn dersom dere ikke ønsker det. Jeg gjør oppmerksom på at mitt visningsnavn er "Elanor". Dette fordi jeg er tilknyttet flere blogger med min gmail-konto og jeg ikke ønsker bruke mitt egentlig navn på disse. For å unngå forvirring, skal jeg passe på å skrive under med "Marita" når jeg publiserer innlegg.
Om å publisere innlegg
Når du har blitt medforfatter i bloggen, og kan publisere innlegg i den. For å publisere på bloggen bruker du adressen blogger.com og logger deg inn. For å opprette et innlegg, bruker du lenken "Nytt innlegg".
Litt om etiketterDet er flere måter å finne frem i denne bloggen på:
-Lete deg frem kronologisk
-Søke i søkeboksen øverst på siden
-Etiketter
Etiketter er ord som beskriver innholdet i innlegget. Vi kan bruke så mange vi vil pr. innlegg. I dette innlegget har jeg brukt Blogging som etikett. Derfor står det nå Blogging (1) i etikettmenyen til høyre. Dersom jeg bruker denne etiketten i et innlegg til, vil det stå Blogging (2). Klikker jeg på denne lenken vil de to innleggene som handler om blogging komme opp.
-Marita-
Slik blir du medforfatter i bloggen
1) Opprett en gmail / google -konto (dersom du ikke allerede har dette). Dere kan f.eks. registrere dere her: https://www.blogger.com/signup.g
2) Send meg e-postadressen deres, og deretter sender jeg dere en e-post der det vil stå følgende:
Elanor har invitert deg til å bidra til bloggen sin, "Bibliotekarenes kunnskapsbank". Klikk på knappen under for å godta denne invitasjonen.
[Godta invitasjonen]
Viktig: Du må logge deg på med en Google-konto for å kunne godta invitasjonen og begynne å bidra til denne bloggen. Hvis du ikke har noen Google-konto, kan du opprette en her.
God blogging!
3) Klikk på lenken, og følg instruksene videre.
Om visningsnavn
Dette trenger ikke være fullt navn dersom dere ikke ønsker det. Jeg gjør oppmerksom på at mitt visningsnavn er "Elanor". Dette fordi jeg er tilknyttet flere blogger med min gmail-konto og jeg ikke ønsker bruke mitt egentlig navn på disse. For å unngå forvirring, skal jeg passe på å skrive under med "Marita" når jeg publiserer innlegg.
Om å publisere innlegg
Når du har blitt medforfatter i bloggen, og kan publisere innlegg i den. For å publisere på bloggen bruker du adressen blogger.com og logger deg inn. For å opprette et innlegg, bruker du lenken "Nytt innlegg".
Litt om etiketterDet er flere måter å finne frem i denne bloggen på:
-Lete deg frem kronologisk
-Søke i søkeboksen øverst på siden
-Etiketter
Etiketter er ord som beskriver innholdet i innlegget. Vi kan bruke så mange vi vil pr. innlegg. I dette innlegget har jeg brukt Blogging som etikett. Derfor står det nå Blogging (1) i etikettmenyen til høyre. Dersom jeg bruker denne etiketten i et innlegg til, vil det stå Blogging (2). Klikker jeg på denne lenken vil de to innleggene som handler om blogging komme opp.
-Marita-
Abonner på:
Innlegg (Atom)